在选择参考文献管理软件时，用户需结合自身使用场景（如学术写作、团队协作、格式兼容性等）综合评估，目前主流工具各有优势,以下是具体分析及推荐。
主流参考文献软件功能对比
为直观展示不同工具的特点，可从核心功能、平台支持、协作能力、优缺点等维度进行对比（部分功能以“√”表示支持，“×”表示不支持，“部分”表示需插件或特定版本支持）：
| 软件名称 | 核心功能（文献导入、格式化、笔记管理） | 平台支持（Windows/macOS/Linux/iOS/Android） | 协作功能（共享库、评论、版本控制） | 免费版限制 | 主要优势与不足 |
|---|---|---|---|---|---|
| EndNote | √（支持PDF导入、超3000种样式） | √（全平台） | √（共享库、团队协作） | 仅3000条本地文献，云端存储付费 | 优势：老牌软件，与Word集成度高，适合大型团队；不足：界面较复杂，免费版功能受限。 |
| Zotero | √（浏览器插件抓取、PDF标注） | √（全平台，移动端为查看端） | √（群组共享、云端同步） | 免费，无文献数量限制 | 优势：开源免费，扩展丰富（如Zotero File Storage），适合个人及小型团队；不足：大型库同步可能卡顿。 |
| Mendeley | √（自动提取元数据、PDF阅读器） | √（全平台） | √（学术社交、共享群组） | 2GB免费云端存储 | 优势：界面简洁，内置PDF阅读器，适合初学者；不足：商业软件后，部分高级功能需付费。 |
| NoteExpress | √（本地数据库管理、国标格式支持） | √（Windows/macOS，移动端支持有限） | √（团队局域网协作） | 个人免费，商业版需授权 | 优势：国内高校常用，对中文文献及GB/T 7714格式支持完善；不足：云端功能较弱，跨平台同步不便。 |
| Papers | √（文献智能分类、PDF批注） | √（macOS/iOS，Windows支持有限） | √（iCloud同步、共享文件夹） | 基础功能免费，高级功能订阅 | 优势：苹果生态体验佳，适合Mac/iOS用户；不足：跨平台支持差，Windows用户无法使用核心功能。 |
不同场景下的软件推荐
个人学术写作（学生/研究者）
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首选：Zotero
开源免费且无文献数量限制，通过浏览器插件（Zotero Connector）可一键抓取网页文献（如知网、PubMed、Google Scholar），支持PDF标注、笔记关联，搭配Zotero File Storage（免费300MB，可扩展）实现云端同步，扩展插件（如Better BibTeX、Zotero PDF Viewer）可进一步提升效率，适合个人文献管理与论文写作。 -
备选：EndNote
若需与团队协作或处理超大型文献库（如医学领域），EndNote的共享库功能（支持多成员编辑）和更强的数据库兼容性（如EndNote Online连接Web of Science）更具优势，但需接受免费版的文献数量限制。
团队协作与科研项目
- EndNote或Zotero
- EndNote：适合大型团队，其“Group”功能可设置不同权限（如管理员、编辑者、查看者），支持文献库版本控制，适合需要统一管理文献的实验室或课题组。
- Zotero：通过“群组”（Group）功能实现免费共享，支持成员上传文献、添加评论，且可通过Zotero Server或第三方云盘（如Nextcloud）搭建私有同步服务器，兼顾灵活性与成本控制。
中文文献与国内格式需求
- NoteExpress
针对中文文献优化，支持知网、万方、维普等数据库的本地导入，对GB/T 7714、MLA等中文常用格式支持更精准，且内置“引文-参考文献”自动校对功能，适合国内高校学生及投稿中文期刊的用户。
苹果生态用户
- Papers
深度整合macOS与iOS系统，通过iCloud同步文献，支持Apple Pencil在iPad上直接批注PDF，界面简洁美观，适合习惯苹果设备的用户，但Windows用户需谨慎选择。
总结建议
- 追求免费与灵活性：选Zotero，开源生态和扩展功能能满足绝大多数个人需求。
- 团队协作与专业数据库：选EndNote，尤其在医学、生物学等需频繁连接国际数据库的领域。
- 中文写作与本土化需求：选NoteExpress，对国内学术场景适配更佳。
- 苹果全设备用户：选Papers，生态内体验无短板。
最终选择可结合现有设备、预算及文献类型试用后再决定，多数软件提供免费试用期（如EndNote 30天试用，Zotero完全免费）,通过实际操作感受功能适配性更稳妥。
相关问答FAQs
Q1：Zotero和EndNote的文献同步功能哪个更稳定？
A：Zotero的同步依赖官方服务器（免费300MB）或自建服务器，基础同步稳定，但大型文献库（上万条）可能因网络卡顿；EndNote同步需通过EndNote Online（免费版需注册，支持最多5GB存储），与Web of Science等数据库联动更紧密，适合需频繁更新文献信息的用户，但免费版同步次数有限制，总体而言，Zotero免费版同步更灵活，EndNote付费版同步更高效。
Q2：使用NoteExpress时，如何解决与Word兼容性问题？
A：NoteExpress在Windows/macOS平台通过专属插件（“NoteExpress Word插件”）实现引文插入与格式化，若出现兼容性问题（如Word版本更新后插件失效），可尝试以下方法：1. 重新下载最新版NoteExpress及插件；2. 在Word中手动启用“加载项”（文件→选项→加载项→管理COM加载项→勾选NoteExpress Add-in）；3. 若仍无法解决,可联系NoteExpress客服获取适配新版Word的补丁包。
